卷一/太阳篇上辨列太阳条例大意太阳正治法第一太阳病脉证三条桂枝汤脉证七条桂枝汤禁三条麻黄汤脉证七条合病证治六条辨伤寒受病阴阳不同一条太阳病愈时日及欲解之候与传经之证六条太阳权变法第二不可发汗例十条桂枝
电子版序郑钦安原序张仲景原序（校补）前言凡例伤寒恒论一百一十三方总目一百一十三方总目太阳上篇 计一十四方太阳中篇 计三十五方太阳下篇 计一十四方阳明上篇 计四方阳明中篇 计四方少阳篇 计二方合病篇 计
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简介序凡例九条卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九
序凡例卷一·慎疾法语省身修德卫生总要饮食宜忌养生铭保命箴寡欲说延年六字诀惜三宝益五脏先时加谨摄生要言勿药须知十二段动功行功六字静功解十二时病为善去疾吕祖治百病符卷二·杂症头疾面疾眼疾耳疾鼻病口病唇病舌
序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
自叙序卷一总论部痈疽之脉痈疽之源痈疽之别痈疽生死法察形色顺逆法内消内托法虚实症治法经络大略十二经补泻药品针砭灸烙烘照蒸拔等法针砭灸烙卷一论症治次第虚实顺逆标本论治药忌辨症论溃疡论脓血论疮口生肌验膜症变
前言辅行诀脏腑用药法要一 辨肝脏病证文并方二 辨心脏病证文并方三 辨脾脏病证文并方四 辨肺脏病证候文并方五 辨肾脏病证文并方六 五脏泻方七 救五脏诸劳损病方八 二旦六神大小汤九 救五脏中恶卒死方附录
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一