原叙卷上咽喉说喉科总论诸风秘论阴阳论辨面色论坏症须知论证附：纂咽喉不治症喉风三十六症斗底风叉喉风咽疮风鱼鳞风双松子风单松子风帝中风双鹅风单鹅风双燕口风单燕口风重风木舌风重舌风坐舌莲花风合架风角架风爆骨
济生方
石山医案
血證論卷一 陰陽水火氣血論卷二 吐血卷三 汗血卷四 便血卷五 瘀血卷六 癆瘵卷七卷八 方劑
序一序二序三序四序五序六序七内经要旨序跋凡例助梓缙绅诸公氏号卷之一 历世圣贤名医姓氏五帝三代秦汉魏吴蜀晋南北朝隋唐五代宋金元皇明采摭诸书卷之二 内经要旨（上）唐太仆令启玄子王冰序校上内经素问表阴阳
序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
方症会要
经症十八问胎前三十四问产后三十四问杂症四十三问
自序卷之一痈疽门痈疽原委论第一痈疽治法总论第二痈疽阳症歌第三痈疽阴症歌第四痈疽半阴半阳症歌第五痈疽五善歌第六痈疽七恶歌第七治病则例歌第八痈疽灸法并禁灸疮穴第九论病生死法第十察形色顺逆第十一病有三因受病
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又