卷一明堂灸经序铜人针灸经序太平圣惠方针经序流注针经序常山阎明广序燕山牛良 序资生经序赵编序大德丁未阆中郡蒲登辰序流注指微针赋针经标幽赋流注通玄指要赋九针论灸刺论卷二论针之名论三阳三阴经脉论虚实补泻论下
《神农本草经》简介邵序张序孙序周序上经（上品）玉石丹沙云母玉泉石钟乳涅石消石朴消滑石石胆空青曾青禹余粮太乙余粮白石英紫石英青石、赤石、黄石、白石、黑石脂等白青扁青草菖蒲鞠华人参天门冬甘草干地黄术菟丝子
伤寒论翼
难经集注
辨症玉函
序卷上总论指南赋入门察色五视法面上诸穴歌小儿无患歌调护歌入门候歌入门试法四十九脉图解详解脉纹辨色歌五指冷热歌审候歌脉法歌闻小儿声音辨小儿五音阳掌十八穴疗病诀阴掌九穴疗病诀附臂上五穴疗病诀足部十三穴疗病
序卷上形诊总义身形内应脏腑部位篇身形内应脏腑病证篇卷上形诊生形类三人篇阳人阴人篇五人篇二十五人篇三阳上下气血多少形状篇辨皮色不胜四时之风篇辨寿夭肥瘦勇怯忍痛不忍痛胜毒不胜毒形状篇辨善病风厥消瘅寒热痹积
断死证秘诀秘受不治法受伤治法通用方秘传方附录 验方四则
石药尔雅
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论