序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
第1部分第2部分第3部分第4部分
序医治整理补接次第口诀又治伤损方论
简介序卷一·温热论·续医案卷二·公选良方内外科卷三·公选良方卷四·公选良方
简介序新校正补注内经素问表凡例内篇 卷之一内篇 卷之二内篇 卷之三外篇 卷之四外篇 卷之五外篇 卷之六外篇 卷之七外篇 卷之八外篇 卷之九
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八
序卷一治喉秘法治喉要诀临症二十法焦氏喉症图形针药秘传单方治喉痹单方卷二应用良方焦氏喉科煎药方诸穴灸刺各法附方
序一序二序三自序卷一草部黄甘草人参北沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝蒌实天花粉夏枯草昆布独活羌活防风本葛
上卷总论类妇人九证论难易上卷经脉类经脉之本经脉诸脏病因经不调调经论外备用方血热经早血热论外方血热经迟血寒经迟血寒论外方血虚经乱肾虚经乱经期腹痛经痛论外方崩淋经漏不止治崩淋经漏之法崩漏论外方杀血心痛热入