张序卷上卷下跋
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
卷之一周身经穴赋十二经脉歌十二经本一脉歌经穴起止歌十五脉络歌经脉气血多少歌禁针穴歌禁灸穴歌血忌歌逐日人神歌九宫尻神歌太乙人神歌孙思邈先生针十三鬼穴歌长桑君天星秘诀歌马丹阳天星十二穴并治杂病歌四总穴歌千
上品卷第一玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石芒硝滑石紫石英白石英青石脂赤石脂黄石脂白石脂黑石脂太一禹余粮禹余粮青玉白玉髓璧玉合玉石陵石碧石青五羽石石流青石流赤六芝赤箭龙眼猪苓茯苓茯神
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
自序新刻难经悬解叙卷上一难二难三难四难五难六难七难八难九难十难十一难十二难十三难十四难十五难十六难十七难十八难十九难二十难二十一难二十二难二十三难二十四难二十五难二十六难二十七难二十八难二十九难三十难
治愈半身不遂一例治愈智迟一例治愈胆虚一例治愈呆病一例治愈高热一例治愈胃脘痛一例治愈梅核气一例治愈脏躁一例治愈偏枯一例治头风一例
序卷之一五绝死第一虚劳第二诸风第三伤寒时疫第四中诸毒第五诸虫蛇伤第六头痛第七咽喉第八心病第九腹痛第十腰痛第十一疝气第十二诸气第十三香港脚第十四水蛊第十五痰嗽第十六胃病呕噎第十七诸血第十八消渴第十九霍乱
肠痈急劳走马牙疳西法化验倒视痧秽宜嚏、过饱宜吐痧症、鼠疫寒包暑热久咳、风温咳风寒二便不通神昏谵语（一）用药分量胎黄鼻衄湿温、疝气、风疹、热入血室、阳明经白虎证、天花、时气肝气为湿热所遏 痘不化浆神昏谵
妇科总括卷一调经门天癸月经之原妇人不孕之故月经之常月经异常外因经病内因经病不内外因经病血色不正病因气秽清浊病因愆期前后多少经行发热时热经行寒热身痛经行腹痛经行泻吐错经妄行成吐衄崩经水过多兼时下白带调经