袁序陆序陆序自序卷一原因原贼邪原风湿原荣卫原易伤寒温热延医论论河间说伤寒之误原瘴原痧原胎成注《伤寒论》论五志论阴阳交并论虫论温疫总论疟论尸疰疳蒸四大症论虚劳论传尸劳论肺萎论正水风水诊法论女劳疸黑疸同治
汪序自序乔序凡例卷一《内经》纂要上古天真论篇四气调神大论篇生气通天论篇金匮真言论篇阴阳应象大论篇阴阳离合论篇阴阳别论篇灵兰秘典论篇六节脏象论篇五脏生成篇五脏别论篇移精变气论篇汤液醪醴论篇诊要经终论篇脉
吴序尤序薛序卷上卷下纳音释义静观居士云游疏
传信适用方
风劳臌膈四大证治
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
神农本草经赞
序序卷第一经络图卷第二脉穴图卷第三卷第四卷第五卷第六卷第七卷第八卷第九卷第十卷第十一卷第十二卷第十三卷第十四卷第十五卷第十六卷第十七卷第十八卷第十九卷第二十卷第二十一卷第二十二 伤寒十劝
序一序二卷一草部上人参黄术甘草山药薏苡仁何首乌百合菟丝子淫羊藿巴戟天肉苁蓉地黄天门冬麦门冬葳蕤牛膝续断五味子沙参芍药当归紫菀知母秦艽石斛延胡索细辛小茴香远志菖蒲肉豆蔻附子补骨脂益智子木香半夏卷二草部下
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一