序凡例卷之一医学或问中风附∶胃风伤寒卷之二瘟疫斑疹内伤中暑湿证燥证火热郁证痰饮咳嗽哮喘疟证霍乱泄泻卷之三痢呕吐噎膈HT逆吞酸嘈杂嗳气痞满肿胀积聚虚损劳极卷之四眩运头痛胃脘痛腹痛腰痛胁痛诸气疝气香港脚痛
仁斋直指方论
博物汇编艺术典医部全录之1博物汇编艺术典医部全录之2博物汇编艺术典医部全录卷001至卷046之1博物汇编艺术典医部全录卷001至卷046之2博物汇编艺术典医部全录卷001至卷046之3博物汇编艺术典医
医验随笔
简介奇效良方内容细目卷之一 风门（附论）（一）卷之二 风门（附论）（二）卷之三 风门（附论）（三）卷之四 寒门（附论）卷之五 暑门（附论）卷之六 湿门（附论）卷之七 燥门（附论）卷之八 火门（附论）卷
序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
鬼门十三针
卷一四诊总括察色听声审病切脉虎口三关部位脉纹形色初生门（上）拭口（附下胎毒法）断脐浴儿藏胎衣法天德月空剃头不啼不乳眼不开吐不止不小便不大便大小便不通肛门内合噤口撮口脐湿脐疮脐突脐风天钓内钓盘肠气痛卷二
喉部论喉症喉症总论辨喉症经络治法喉科辨症双松症单松症双燕子症单燕子症双鹅症单鹅症双缠症单缠症悬蜞症合架症圹症瘰症乘枕症乘颚症斗底症HT症联珠症破头症掩头症大头症穿额症鱼鳞症玉笋症莲花症梅花症黑疔症抢食
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一