序正文卷（一）独参汤参附汤生脉饮保元汤四君子汤香砂六君子汤当归补血汤佛手散四物汤圣愈汤地骨皮饮犀角地黄汤四生丸当归六黄汤黄建中汤双和饮人参养荣汤归脾汤妙香散天王补心丹酸枣仁汤朱砂安神丸卷（二）补中益气
序卷上全论大法第一六经正义第二合并启微第三风寒辨惑第四温暑指归第五湿异同第六平脉准绳第七卷下大阳病解第一阳明病解第二少阳病解第三太阴病解第四少阴病解第五厥阴病解第六制方大法第七
序一序二医之可法为问卷之一医学指南总诀二首卷之一本草第一药本五味一首药性指掌九十首妊娠服禁引经药报使六陈十八反(二首并出儒门事亲)十九畏(一首)用药法象(一首)卷之二脉诀第二诊脉入式(一首集次王适斋等
析骨分经
伤寒论类方
针经节要
自叙上卷原病温疫初起传变不常急证急攻表里分传热邪散漫内壅不汗下后脉浮下后脉复沉邪气复聚下后身反热下后脉反数因证数攻病愈结存下格注意逐邪勿拘结粪蓄血发黄邪在胸膈辨明伤寒时疫发斑战汗合论战汗自汗盗汗狂汗发
咽喉大纲咽舌两经看症凡例治症秘诀用药秘诀各症形象主治歌喉症总论歌辨症总诀看症治法歌辨证用药歌喉症通剂歌舌症通剂歌牙症通剂歌喉症煎方歌喉科诸症煎剂歌喉舌牙三症煎方歌喉舌牙三症并牙疳煎方歌玉丹配法歌金丹配
锲斗垣申君校正外科启玄序序校正外科启玄自序外科启玄附痘科序后序卷之一明疮疡标本论明疮疡脉理论明疮疡是阴阳相滞论明疮疡分五善七恶论明疮疡原无定处论明疮疡色脉形症当参相应论明疮疡部位所属经络论明疮疡生十二
陈序童序自序增补本草备要自序本草备要凡例药性总义内容草部黄甘草人参沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗荠马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝楼仁